丛集性头痛容易与典型偏头痛鉴别，但不易与非典型偏头痛鉴别。丛集性头痛一般无家族史，发作时没有先兆，多在恒定时间发作，持续时间较短，但疼痛程度更重;典型偏头痛有家族易感性，发作时可以有先兆，持续时间较长，疼痛程度不如丛集性头痛。
丛集性头痛和偏头痛的发作特点存在差异。丛集性头痛以一侧眼眶周围的突发性剧烈胀痛或钻痛为主，可在短时间内扩散到同侧额颞部和顶枕部;典型偏头痛可以有先兆期，患者可在发作前慢慢出现视觉异常、语言障碍等症状，并且发作时的疼痛程度比丛集性头痛程度轻。
丛集性头痛患者一般没有家族史，患者多为二十到四十岁的青年人，男性发病率大于女性;偏头痛具有遗传易感性，大约半数以上的偏头痛患者有家族史，好发于中青年人群，女性发病率大于男性。
丛集性头痛的发作时间较恒定，有连续和密集发作的特点，一天内可以多次发作，持续时间一般为十五到一百八十分钟，;大多数偏头痛患者的头疼持续四到七十二小时，每个月发生两到四次。但也有部分患者两到三天就发作一次，或一年只发生一两次。
