不建议使用连花清瘟来预防新冠病毒，虽然连花清瘟胶囊对轻症及普通患者有效，连花清瘟对抗病毒作用较弱，但对病毒引起的组织细胞损伤有很好的抑制作用，而且对减轻发烧、咳嗽、加快恢复都具有一定的效果，但盲目用药可能会导致副作用的发生。
临床研究发现连花清瘟胶囊可以提高细胞免疫的能力，对感染流感病毒后血中的诱导T淋巴细胞及细胞毒T淋巴细胞的下降有一定的抑制作用。在多年来使用连花清瘟胶囊的研究上发现，连花清瘟制剂具有广谱抗病毒的作用，对于甲型流感病毒和普通感冒病毒都具有较好的抑制拮抗作用。
虽然连花清瘟胶囊对新冠病毒并没有很好的抑制拮抗作用，但连花清瘟能有效缓解感染新冠病毒的并发症。连花清瘟对新冠带来的发烧、咳嗽等症状都有较好的效果。但连花清瘟一般只用于新冠轻症的治疗。
不建议使用连花清瘟来预防新冠，没有患病的情况下随意服用连花清瘟可以会带来副作用。以免出现胃肠道反应，如恶心、呕吐、或出现其他全身的症状，如全身乏力等不适症状。且有些患者可能会对连花清瘟中的某些成分过敏。
